Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms