Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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