Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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