Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
STX4Q12846 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms