Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms