Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms