Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC11A1P49279 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC11A1P49279 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC11A1P49279 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SLC11A1P49279 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms