Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IFITM1P13164 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms