Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HELTA6NFD8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms