Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms