Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
A4GALTQ9NPC4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
A4GALTQ9NPC4 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
A4GALTQ9NPC4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
A4GALTQ9NPC4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
A4GALTQ9NPC4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
A4GALTQ9NPC4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
A4GALTQ9NPC4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
A4GALTQ9NPC4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
A4GALTQ9NPC4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
A4GALTQ9NPC4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
A4GALTQ9NPC4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
A4GALTQ9NPC4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
A4GALTQ9NPC4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
A4GALTQ9NPC4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
A4GALTQ9NPC4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
A4GALTQ9NPC4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms