Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC9Q8NEP7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms