Protein–RNA interactions for Protein: Q6J4K2

SLC8B1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1Q6J4K2 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC8B1Q6J4K2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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