Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms