Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms