Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD4Q5VX71 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms