Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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FOXI1Q12951 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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FOXI1Q12951 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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FOXI1Q12951 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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