Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms