Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC1Q08554 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms