Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN11Q06124 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms