Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms