Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms