Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 DCUN1D3-202ENST00000563934 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms