Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms