Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC8A2Q9UPR5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A2Q9UPR5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms