Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG5Q9UPR3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms