Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms