Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCM9Q9NXL9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms