Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 SSBP4-204ENST00000597724 865 ntTSL 517.39■□□□□ 0.371e-7■■■■□ 22.5
SLTMQ9NWH9 SSBP4-211ENST00000601614 628 ntTSL 216.38■□□□□ 0.211e-7■■■■□ 22.5
SLTMQ9NWH9 SSBP4-214ENST00000607020 504 ntTSL 315.39■□□□□ 0.051e-7■■■■□ 22.5
SLTMQ9NWH9 SSBP4-215ENST00000625926 162 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.611e-7■■■■□ 22.5
SLTMQ9NWH9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.441e-6■■■■□ 22.5
SLTMQ9NWH9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 22.5
SLTMQ9NWH9 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.151e-6■■■■□ 22.5
SLTMQ9NWH9 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 22.5
SLTMQ9NWH9 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.555e-7■■■■□ 22.5
SLTMQ9NWH9 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.785e-7■■■■□ 22.5
SLTMQ9NWH9 BCOR-206ENST00000406200 4216 ntTSL 210.06□□□□□ -0.85e-7■■■■□ 22.5
SLTMQ9NWH9 MAD1L1-205ENST00000421113 564 ntTSL 419.99■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 22.4
SLTMQ9NWH9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.496e-7■■■■□ 22.4
SLTMQ9NWH9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.276e-7■■■■□ 22.4
SLTMQ9NWH9 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.256e-7■■■■□ 22.4
SLTMQ9NWH9 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 516.51■□□□□ 0.236e-7■■■■□ 22.4
SLTMQ9NWH9 PRR5-210ENST00000459857 560 ntTSL 420.36■□□□□ 0.856e-7■■■■□ 22.4
SLTMQ9NWH9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 22.4
SLTMQ9NWH9 MAD1L1-209ENST00000438959 839 ntTSL 314.37□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 22.4
SLTMQ9NWH9 CTTN-205ENST00000415461 1021 ntTSL 320.84■□□□□ 0.932e-6■■■■□ 22.4
SLTMQ9NWH9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.572e-6■■■■□ 22.4
SLTMQ9NWH9 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 22.4
SLTMQ9NWH9 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.12e-6■■■■□ 22.4
SLTMQ9NWH9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.534e-7■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.16■□□□□ 0.54e-7■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.334e-7■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.314e-7■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.214e-7■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.264e-7■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 SNTB1-204ENST00000519298 414 ntTSL 35.4□□□□□ -1.542e-7■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 KDM4B-209ENST00000592159 411 ntTSL 310.01□□□□□ -0.815e-7■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 TBKBP1-203ENST00000578982 733 ntTSL 319.66■□□□□ 0.743e-7■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.861e-6■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.21e-6■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.631e-6■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.531e-6■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 INPP4A-210ENST00000523221 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.581e-6■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 RSRP1-208ENST00000561867 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.67■□□□□ 0.428e-7■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 RSRP1-220ENST00000568996 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.02■□□□□ 0.168e-7■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 RSRP1-204ENST00000473314 3034 ntTSL 215.02■□□□□ -08e-7■■■■□ 22.3
SLTMQ9NWH9 MAEA-218ENST00000513301 595 ntTSL 417.48■□□□□ 0.393e-8■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 MAEA-217ENST00000512842 550 ntTSL 414.71□□□□□ -0.053e-8■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.11e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 ITPR2-203ENST00000451599 2577 ntTSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.671e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 MAPK8IP3-212ENST00000567849 551 ntTSL 55.17□□□□□ -1.585e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-211ENST00000476772 1683 ntTSL 1 (best)29.98■■■□□ 2.392e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.032e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.952e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.912e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)26.25■■□□□ 1.792e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.792e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.782e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.782e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.782e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.782e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.782e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.782e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.782e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.782e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.662e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 222.85■■□□□ 1.252e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.62e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.322e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-216ENST00000512683 475 ntTSL 1 (best)13.01□□□□□ -0.332e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.355e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.415e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 EXD3-211ENST00000490886 1123 ntTSL 519.66■□□□□ 0.745e-9■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC12.81□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 MAD1L1-210ENST00000444373 535 ntTSL 416.21■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 APBA2-209ENST00000559709 594 ntTSL 425.08■■□□□ 1.613e-6■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 APBA2-208ENST00000558804 535 ntTSL 412.98□□□□□ -0.333e-6■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 CAPN15-206ENST00000568402 540 ntTSL 414.94□□□□□ -0.022e-7■■■■□ 22.2
SLTMQ9NWH9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.58e-7■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.228e-7■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 POLR2J4-201ENST00000422304 974 ntTSL 29.14□□□□□ -0.958e-7■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.718e-7■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.547e-7■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.227e-7■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 ABHD17A-203ENST00000588598 5425 ntTSL 222.64■■□□□ 1.223e-8■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 ABHD17A-205ENST00000591351 4647 ntTSL 219.73■□□□□ 0.755e-8■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.062e-6■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 KCNAB2-215ENST00000472700 536 ntTSL 515.25■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 KCNAB2-204ENST00000378083 4142 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 OAZ1-204ENST00000588673 780 ntTSL 321.22■□□□□ 0.992e-11■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 CERS4-203ENST00000558268 713 ntTSL 326.24■■□□□ 1.792e-6■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 CERS4-210ENST00000559490 420 ntTSL 522.3■■□□□ 1.162e-6■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 CERS4-213ENST00000561053 768 ntTSL 520.39■□□□□ 0.852e-6■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 CERS4-206ENST00000558501 873 ntTSL 518.25■□□□□ 0.512e-6■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 CERS4-211ENST00000560412 568 ntTSL 417.86■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 CERS4-212ENST00000561008 531 ntTSL 415.86■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 22.1
SLTMQ9NWH9 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)20.24■□□□□ 0.831e-7■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 416.61■□□□□ 0.251e-7■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 315.06■□□□□ 01e-6■■■■□ 22
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