Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A13Q9NSD5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms