Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAP1Q9BWH6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms