Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF4Q9BUZ4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms