Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTKNQ9BST9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms