Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms