Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC9Q96Q05 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms