Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC7Q96M83 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC7Q96M83 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CCDC7Q96M83 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC7Q96M83 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC7Q96M83 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC7Q96M83 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC7Q96M83 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms