Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC150Q8NCX0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC150Q8NCX0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC150Q8NCX0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC150Q8NCX0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC150Q8NCX0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC150Q8NCX0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC150Q8NCX0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC150Q8NCX0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC150Q8NCX0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms