Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A8

PLD6, Mitochondrial cardiolipin hydrolase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD6Q8N2A8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLD6Q8N2A8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD6Q8N2A8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLD6Q8N2A8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLD6Q8N2A8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD6Q8N2A8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD6Q8N2A8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD6Q8N2A8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD6Q8N2A8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD6Q8N2A8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD6Q8N2A8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD6Q8N2A8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD6Q8N2A8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD6Q8N2A8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLD6Q8N2A8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLD6Q8N2A8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLD6Q8N2A8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms