Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
APTXQ7Z2E3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms