Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTW8

OTOA, Otoancorin, humanhuman

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOAQ7RTW8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOAQ7RTW8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOAQ7RTW8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOAQ7RTW8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOAQ7RTW8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOAQ7RTW8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOAQ7RTW8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOAQ7RTW8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOAQ7RTW8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOAQ7RTW8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOAQ7RTW8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOAQ7RTW8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOAQ7RTW8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOAQ7RTW8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOAQ7RTW8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOAQ7RTW8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOAQ7RTW8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOAQ7RTW8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOAQ7RTW8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOAQ7RTW8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOAQ7RTW8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOAQ7RTW8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOAQ7RTW8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOAQ7RTW8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOAQ7RTW8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOAQ7RTW8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms