Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY4Q6ZNE9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY4Q6ZNE9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms