Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZRN4Q6ZMN7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN4Q6ZMN7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms