Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGAP6Q5VW22 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms