Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW2

NHSL2, NHS-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL2Q5HYW2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHSL2Q5HYW2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NHSL2Q5HYW2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NHSL2Q5HYW2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NHSL2Q5HYW2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NHSL2Q5HYW2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NHSL2Q5HYW2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NHSL2Q5HYW2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NHSL2Q5HYW2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NHSL2Q5HYW2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NHSL2Q5HYW2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NHSL2Q5HYW2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NHSL2Q5HYW2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NHSL2Q5HYW2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NHSL2Q5HYW2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NHSL2Q5HYW2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NHSL2Q5HYW2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NHSL2Q5HYW2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms