Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBF2

WSCD2, WSC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD2Q2TBF2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WSCD2Q2TBF2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
WSCD2Q2TBF2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms