Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC9A3R2Q15599 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC9A3R2Q15599 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
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