Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECH1Q13011 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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