Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms