Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms