Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC4Q03721 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms